当3岁孩子发烧至39℃时，可采取以下步骤进行处理：
1.测量体温：使用体温计测量孩子的体温，确保测量准确。
2.补充水分：让孩子多喝水，以补充因发烧而流失的水分，防止脱水。
3.松解衣物：孩子发烧时，不要给孩子穿过多的衣物，以免影响散热。
4.物理降温：用温水擦拭孩子的手心、腋窝、腹股沟等部位，或使用退热贴等物理方法降温。
5.药物治疗：如果孩子的体温持续升高或出现其他不适症状，可在医生的指导下使用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚等。
6.就医治疗：如果孩子的体温超过39℃，或出现精神萎靡、呼吸急促等症状，应及时就医，进行进一步的检查和治疗。
此外，在处理孩子发烧时，还应注意以下几点：
1.密切观察孩子的病情变化，如体温、精神状态、呼吸等。
2.避免使用酒精擦拭孩子的身体，以免引起酒精中毒。
3.不要给孩子使用捂汗的方法退烧，以免引起捂热综合征。
4.注意保持孩子的口腔清洁，多喝水，以缓解喉咙疼痛等不适症状。
5.孩子发烧时，应避免带孩子去人员密集的场所，以免交叉感染。
总之，当孩子发烧至39℃时，家长应密切观察孩子的病情变化，及时采取相应的措施进行处理。如果孩子的病情加重或持续不缓解，应及时就医，以免延误病情。