3岁半宝宝身高90cm不一定是矮小症，可能与多种因素有关。以下是一些可能的原因：
1.遗传因素：宝宝的身高与遗传有很大关系。如果父母身高较矮，宝宝可能也会相对较矮。
2.营养因素：宝宝的营养状况对身高发育也有重要影响。如果宝宝摄入的营养不足，可能会影响身高增长。
3.疾病因素：某些疾病可能会影响宝宝的身高发育，如生长激素缺乏症、甲状腺功能减退症等。
4.其他因素：宝宝的生活环境、睡眠质量、运动量等也可能对身高产生影响。
如果家长对宝宝的身高有疑虑，建议及时带宝宝去医院就诊，进行全面的身体检查和评估。医生会根据宝宝的具体情况，给出相应的建议和治疗方案。
对于3岁半宝宝身高90cm的情况，家长可以采取以下措施：
1.注意营养均衡：保证宝宝摄入足够的蛋白质、维生素、矿物质等营养物质，多吃富含钙的食物，如奶制品、豆制品、海鲜等。
2.保证充足睡眠：宝宝的睡眠对身高发育非常重要，建议保证宝宝每天有足够的睡眠时间，创造良好的睡眠环境。
3.适量运动：适当的运动可以促进宝宝的生长发育，家长可以带宝宝进行一些适合的运动，如游泳、跳绳、篮球等。
4.定期体检：按照医生的建议，定期带宝宝进行体检，及时发现问题并采取措施。
需要注意的是，每个宝宝的生长发育情况都不同，身高增长也有一定的个体差异。家长应该关注宝宝的整体健康和发育情况，而不仅仅是身高。如果宝宝的身高明显低于同龄人，或者出现其他异常情况，应及时就医咨询。同时，家长也应该保持良好的心态，给宝宝提供一个温馨、和谐的成长环境。