主要筛查以下两种疾病：
苯丙酮尿症：是一种常见的氨基酸代谢病，会引起患儿智力低下。如果能在新生儿期及时发现，尽早治疗，可以避免对宝宝造成严重的伤害。
先天性甲状腺功能减低症：是由于患儿甲状腺先天性缺陷或因母孕期饮食中缺碘所致，若能在出生后3个月内发现，及时治疗，大多可避免智力低下等严重后果。
以上两种疾病若不及时治疗，会对宝宝的智力和身体发育造成严重影响。因此，新生儿足底血筛查非常重要，家长们一定要重视。
此外，在一些地区，足跟血筛查还会检测其他疾病，如先天性肾上腺皮质增生症、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症等。这些疾病的发病率虽然较低，但也会对宝宝的健康造成一定的影响。
总之，新生儿足底血筛查是一种非常重要的检查，可以帮助家长及时发现宝宝的潜在健康问题，采取相应的治疗措施，保障宝宝的健康成长。