大便后小肚子隐隐作痛可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的原因：
1.肠道疾病：如溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠易激综合征等，这些疾病可能导致肠道炎症、痉挛或功能紊乱，引起小肚子隐痛。
2.肛门疾病：痔疮、肛裂、肛瘘等肛门疾病可能引起肛门周围疼痛，排便时疼痛加重，便后可能出现小肚子隐痛。
3.妇科疾病：女性患者可能存在盆腔炎、宫颈炎、子宫内膜异位症等妇科疾病，这些疾病也可能导致小肚子隐痛，尤其在排便后加重。
4.泌尿系统疾病：膀胱炎、尿道炎、前列腺炎等泌尿系统感染或炎症也可能引起小肚子隐痛，常伴有尿频、尿急、尿痛等症状。
5.其他原因：腹部受凉、饮食不当、肠道寄生虫感染、腹部手术后等也可能导致大便后小肚子隐隐作痛。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，具体情况还需要结合患者的具体症状、体征、病史以及相关检查来综合判断。如果疼痛持续不缓解或伴有其他严重症状，如发热、呕吐、腹泻、便秘等，应及时就医，以便明确病因并进行针对性治疗。
此外，保持良好的生活习惯和饮食习惯对预防肠道疾病也非常重要。建议适量运动、饮食均衡、避免过度劳累和压力，保持规律的排便习惯。如果对自己的健康有任何疑虑，最好咨询医生的意见。