乙肝携带者通常可以办理健康证，但需要根据具体情况而定。
根据《食品安全法》及其实施条例规定，乙肝病毒携带者除不能献血、捐献造血干细胞外，可以从事正常的工作、学习和社交活动。乙肝携带者在取得健康证明后，可以从事食品生产经营、公共场所服务、化妆品、一次性医疗卫生用品等行业。
然而，在某些特殊情况下，乙肝携带者可能无法办理健康证。例如，从事直接入口食品工作的人员患有痢疾、伤寒、甲型病毒性肝炎、戊型病毒性肝炎等消化道传染病，以及患有活动性肺结核、化脓性或者渗出性皮肤病等有碍食品安全的疾病的，乙肝携带者也将无法从事这些行业的工作。
总之，乙肝携带者是否可以办理健康证，需要根据具体情况而定。建议乙肝携带者在办理健康证前，先了解相关规定，并咨询当地的卫生部门或相关机构，以确保自己的权益和健康。