三个月婴儿咳嗽可能是生理原因、环境因素、呼吸道感染等原因所致，可以通过一般治疗、药物治疗的方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.生理原因：三个月婴儿的呼吸道黏膜比较娇嫩，容易受到外界刺激而引起咳嗽。比如，宝宝哭闹、大笑、吞咽口水时，可能会导致喉部受到刺激，从而引起咳嗽。此外，宝宝的呼吸道比较狭窄，容易受到分泌物的堵塞，也可能会引起咳嗽。这种情况下，宝宝的咳嗽通常是短暂而轻微的，不需要特殊治疗，家长可以通过给宝宝拍背、喂水等方式缓解。
2.环境因素：如果宝宝所处的环境温度过低、空气干燥，或者有刺激性气味，如烟雾、粉尘等，都可能会刺激宝宝的呼吸道，引起咳嗽。此外，如果宝宝周围的人吸烟，也可能会导致宝宝咳嗽。这种情况下，家长可以适当调整宝宝所处的环境，保持温度适宜、空气湿润，并避免宝宝接触刺激性气味。
3.呼吸道感染：呼吸道感染是三个月婴儿咳嗽最常见的原因之一，如感冒、肺炎等。病毒或细菌感染可能会导致呼吸道黏膜炎症，分泌物增多，从而引起咳嗽。此外，过敏也可能会导致呼吸道炎症，引起咳嗽。如果宝宝咳嗽伴有发热、呼吸急促、喘息等症状，家长应及时带宝宝就医，医生一般会根据宝宝的具体情况给予相应的治疗，如抗病毒或抗生素治疗等。
在治疗期间，家长需要注意给宝宝多喝水，保持呼吸道湿润。同时，家长应避免带宝宝去人多拥挤的场所，以减少感染的机会。宝宝的饮食应清淡易消化，可以适当增加蔬菜和水果的摄入，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物。