前列腺癌根治术后可能出现多种并发症，其中尿失禁较为常见，约有5%~10%的患者在术后短期会出现轻度尿失禁，而长期尿失禁的发生率约为1%~5%。
泌尿系统并发症
尿道狭窄： 术后可能发生尿道狭窄，表现为排尿困难。一般在术后数月内出现，若出现排尿费力等情况需及时就医。膀胱痉挛： 患者可能会有下腹部痉挛性疼痛，伴有尿频、尿急等症状，通常在术后1~2周内较为明显，可能与膀胱黏膜受到刺激等因素有关。
性功能障碍
勃起功能障碍： 前列腺癌根治术可能损伤支配阴茎勃起的神经，术后约70%~80%的患者会出现不同程度的勃起功能障碍，多数在术后3~6个月逐渐恢复，但也有部分患者难以恢复。射精功能障碍： 几乎所有患者术后都会出现射精功能障碍，表现为逆行射精或不射精，这是因为手术影响了射精管道的正常结构。
感染相关并发症
切口感染： 手术切口有发生感染的可能，一般发生率在1%~5%左右，表现为切口红肿、疼痛、有渗出物等。尿路感染： 术后患者若留置尿管等操作，可能引发尿路感染，出现尿频、尿急、尿痛，甚至发热等症状，据统计发生率约为10%~15%。
其他并发症
淋巴囊肿： 较少见，发生率约为1%~2%，是由于淋巴结清扫后淋巴液回流受阻形成囊肿，一般无明显症状时可先观察，较大的囊肿可能需要穿刺引流等处理。深静脉血栓形成： 术后患者活动减少等因素可能导致深静脉血栓，尤其是下肢深静脉血栓，若血栓脱落可能引起肺栓塞等严重后果，不过通过早期预防，如鼓励患者早期活动等，可降低其发生风险。