宝宝发烧39度睡着了通常不能自愈，需要采取适当的措施来帮助宝宝退烧，以下是一些建议：
1.观察宝宝的症状：在宝宝发烧39度睡着了的情况下，需要密切观察宝宝的症状。注意观察宝宝的呼吸、心跳、精神状态等，以及是否出现其他异常症状，如抽搐、意识不清等。如果出现这些症状，应立即就医。
2.给宝宝降温：可以使用物理降温的方法来帮助宝宝退烧，如用温水擦拭宝宝的额头、颈部、腋窝、腹股沟等部位，或给宝宝洗温水澡。也可以使用药物降温，如布洛芬或对乙酰氨基酚等退烧药。但需要注意药物的使用剂量和使用方法，按照医生的建议使用。
3.保持宝宝的水分摄入：发烧会导致宝宝体内水分流失，因此需要保持宝宝的水分摄入。可以给宝宝多喝水或口服补液盐，以防止脱水。
4.就医：如果宝宝的发烧持续时间较长或出现其他异常症状，应及时就医。医生会根据宝宝的具体情况进行诊断，并给予相应的治疗。
需要注意的是，宝宝发烧39度睡着了是一种比较严重的情况，需要及时采取措施来帮助宝宝退烧。同时，在宝宝发烧期间，需要注意保持宝宝的舒适和安静，避免过度活动和刺激。如果宝宝的症状持续加重或出现其他异常情况，应及时就医。