月经干净后两天同房一般不会怀孕，但也不是绝对的。
月经周期的长短因人而异，每个女性的月经周期也可能会有所不同。一般来说，排卵发生在下次月经来潮前14天左右，排卵前后4-5天为易孕期，其他时间则视为安全期。但是，排卵可能会受到环境、情绪、健康状况等因素的影响而提前或推迟，因此安全期避孕的方法并不可靠，有一定的失败率。
此外，精子在女性体内可以存活3-5天，即使在安全期，精子也可能会在女性体内等待卵子的排出，从而导致怀孕。
对于月经周期不规律的女性，或者存在其他影响排卵的因素（如多囊卵巢综合征、内分泌失调等）的女性，安全期避孕就更加不可靠了。
因此，如果没有怀孕的计划，建议采取可靠的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药、宫内节育器等。此外，还需要注意性生活的卫生，避免感染性传播疾病。
对于一些特殊人群，如哺乳期女性，由于哺乳期可能会抑制排卵，导致月经周期不规律，但也可能会发生意外排卵，因此哺乳期女性也需要注意避孕。
总之，虽然月经干净后两天同房怀孕的几率较小，但并不能完全排除怀孕的可能。如果担心怀孕，建议咨询医生或计划生育专业人员，选择适合自己的避孕方法。同时，也要注意保护自己的生殖健康，定期进行妇科检查。