脚拇指指甲边肿痛，通常是由以下原因引起的。
1.甲沟炎：甲沟及其附近组织刺伤、擦伤、嵌甲或拔“倒皮刺”后造成。甲下脓肿则是因为甲沟受伤后感染，甲下积脓引起。
2.感染：细菌通过甲旁皮肤的微创破损袭至皮下并生长繁殖引起。
3.外伤：踢伤、撞伤及碾压伤等，使足趾产生破损，影响到甲床或甲母细胞时趾甲也会出现畸形。
4.其他：先天性局部畸形，或甲床或甲母质部先天性缺陷等也可以导致指甲出现畸形或感染。
如果出现脚拇指指甲边肿痛，应及时就医，根据具体情况进行治疗。同时，要注意保持脚部清洁，避免长时间站立或行走，穿合适的鞋子。