目前，尚无明确有效的药物能使扁平疣直接消退。扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，针对HPV的抗病毒药物可以用于辅助治疗扁平疣，例如外用咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等，也可以口服一些免疫调节剂，如转移因子、胸腺肽肠溶片等，这些药物可以帮助提高免疫力，促进扁平疣消退。
除了药物治疗，还可以采用物理治疗，包括冷冻、电灼、激光等方法，直接去除疣体。此外，患者在治疗期间需要注意皮肤清洁，避免搔抓疣体，以免造成自身接种传染。同时，患者可以适当多吃一些富含维生素C和维生素E的食物，如橙子、猕猴桃、草莓、坚果等，有助于皮肤的修复。
需要注意的是，扁平疣具有传染性，患者应避免与他人共用毛巾、浴巾等物品，同时要注意个人卫生。如果扁平疣症状严重或治疗效果不佳，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。