肛门里疼的原因可能有以下几种：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵裂后形成的感染性溃疡，常发于肛门后、前正中，以肛门周期性疼痛、出血、便秘为主要特点。
疼痛：典型的肛裂疼痛具有典型的周期性。排便时，肛裂裂口内神经末梢受刺激，引起肛管内烧灼样或刀割样疼痛，可放射到臀部、会阴部。便后数分钟疼痛缓解，随后因肛门括约肌收缩痉挛，再次剧痛，可持续数小时，直至括约肌疲劳、松弛后疼痛缓解。
出血：一般出血量较少，呈鲜红色。
便秘：患者因肛门疼痛不愿排便，久而久之引起便秘，粪便更为干硬，便秘又可使肛裂加重，形成恶性循环。
2.肛管炎：肛管炎是长期的粪便刺激和不良的排便习惯引起的，其主要症状是疼痛、瘙痒。
疼痛：肛门部不适感和隐痛，排便时加重。
瘙痒：肛门周围皮肤因搔抓破溃，可导致皲裂、感染，常发生肛门瘙痒和疼痛。
3.肛窦炎：肛窦炎是指肛窦、肛门瓣发生的急慢性炎症，常并发肛乳头炎。肛窦炎的主要症状是肛门内间歇性疼痛，急性炎症期还会出现排便时疼痛加剧、粪便带血、肛门瘙痒等症状。
4.肛周脓肿：是指肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生的急性化脓性感染，并形成脓肿。其主要症状是肛周持续性剧痛，受压或咳嗽时加重，行走不便，坐卧不安，全身感染症状不明显。
5.外痔：外痔位于齿线以下，是由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成的肿块。其主要症状是肛门部有肿物，伴有肛门坠胀或异物感，无疼痛或仅有坠胀感，可伴有局部分泌物或瘙痒。
6.内痔：内痔是发生在齿状线以上的痔，表面覆盖黏膜。内痔的主要症状是便血、痔核脱出、肛门瘙痒。内痔的便血多为鲜红色，呈滴血或喷射状。
7.其他：肛门里疼还可能与肛管或直肠的良恶性肿瘤、肠道感染、寄生虫病、神经官能症等有关。
如果经常出现晚上睡觉被肛门里疼醒的情况，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。