经期适量喝咖啡一般影响不大，但过量饮用可能带来一些问题。研究发现，女性在经期过量喝咖啡（每天超过3杯），可能会使痛经的发生率增加约50%。
对神经及情绪的影响
焦虑情绪加重： 咖啡中的咖啡因会刺激中枢神经系统，经期过量摄入可能让女性更容易出现焦虑、烦躁的情绪。有研究显示，连续3天每天饮用超过400毫克咖啡因（约3杯咖啡）的女性，经期焦虑发生率比少喝咖啡的女性高约20%。睡眠受干扰： 咖啡因有提神作用，经期本就可能因身体不适影响睡眠，若此时还大量喝咖啡，会进一步干扰睡眠，导致睡眠质量下降，进而影响第二天的精神状态和身体恢复。
对身体机能的影响
加重水肿情况： 咖啡因可能会影响身体的水分代谢，部分女性经期本身可能有轻微水肿，过量喝咖啡可能让水肿加重。因为咖啡因会抑制抗利尿激素的分泌，导致排尿减少，水分滞留体内。影响营养吸收： 咖啡中的成分可能会影响铁的吸收，女性经期本身会流失一定量的铁，若同时大量喝咖啡，可能会进一步影响身体对铁的摄取，长期可能增加缺铁性贫血的风险。
对消化系统的影响
刺激肠胃： 咖啡会刺激胃酸分泌，经期女性肠胃功能相对敏感，过量喝咖啡可能引发肠胃不适，出现胃痛、反酸等症状，尤其是本身有肠胃疾病的女性，这种影响可能更明显。加重经期不适反应： 有部分女性在经期喝咖啡后，会感觉头痛症状加重，这可能是因为咖啡因会收缩血管，导致血管舒缩功能紊乱，从而加重头痛等经期不适表现。