宝宝突然高烧39度但没有感冒症状，可能是由以下原因引起的：
1.幼儿急疹：多见于6-18个月的宝宝，一般高热3-5天后，体温突然降至正常，同时出现红色斑丘疹。
2.上呼吸道感染：除了发热，还可能伴有流涕、咳嗽等症状。
3.其他感染：如肺炎、脑炎、尿路感染等，也可能导致发热，而没有明显的感冒症状。
4.疫苗接种后反应：有些疫苗接种后，可能会出现发热等不良反应。
5.川崎病：除了发热，还可能出现皮疹、眼红、颈部淋巴结肿大等症状。
6.其他：如药物热、幼年特发性关节炎等。
如果宝宝突然高烧39度，没有感冒症状，建议及时就医，进行相关检查，如血常规、C反应蛋白等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意给宝宝多喝水，保持室内空气流通，密切观察宝宝的体温、精神状态等变化，如有异常，及时就医。
此外，对于3个月以下的宝宝，一旦出现发热，应立即就医。在就医过程中，要注意给宝宝保暖，避免再次着凉。同时，要避免自行给宝宝使用退烧药，以免掩盖病情。