怀孕有囊肿是否会影响胎儿，取决于囊肿的类型、大小、位置以及孕妇的具体情况。以下是一些需要考虑的因素：
1.生理性囊肿：在怀孕早期，卵巢可能会形成一些生理性囊肿，这些囊肿通常会在怀孕中期自行消失，不会对胎儿造成影响。
2.非赘生性囊肿：如滤泡囊肿、黄体囊肿等，一般也不会影响胎儿。
3.赘生性囊肿：包括浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤、巧克力囊肿等，这些囊肿可能会随着孕期的增长而逐渐增大，甚至发生扭转、破裂等并发症，从而对胎儿产生不良影响。
4.囊肿的大小和位置：如果囊肿较大，或位于子宫底部、阔韧带等部位，可能会压迫胎儿，影响其生长发育。
5.孕妇的症状：如果囊肿引起孕妇腹痛、阴道流血等症状，可能是囊肿发生了并发症，需要及时处理。
因此，对于怀孕后发现的囊肿，孕妇应定期进行超声检查，密切观察囊肿的大小、形态、位置等变化，并结合自身症状，由医生进行综合评估。如果囊肿存在恶变倾向，或引起了明显的不适症状，可能需要进行手术治疗。在治疗过程中，医生会权衡治疗对孕妇和胎儿的影响，选择最合适的治疗方案。
需要注意的是，每个孕妇的情况都不同，因此对于怀孕有囊肿是否会影响胎儿的问题，最好咨询专业的妇产科医生，以获得个性化的建议和指导。同时，孕妇在孕期应保持良好的生活习惯，注意休息，避免剧烈运动和性生活，以保障自身和胎儿的健康。