孩子反复高烧39℃以上，可能由以下原因引起。
1.感染：是引起孩子发烧最常见的原因，如病毒、细菌、支原体、真菌等感染。可完善血常规、C反应蛋白、降钙素原、病毒抗体、痰培养、药敏等检查以明确病因。
2.免疫系统疾病：如幼年特发性关节炎、系统性红斑狼疮、川崎病等，也可导致孩子反复高烧39℃以上。
3.恶性肿瘤：如白血病、淋巴瘤等，可导致孩子免疫力低下，容易发生感染，从而出现反复高烧。
4.其他：如药物热、暑热症、颅内感染、结缔组织病、甲状腺功能亢进等，也可引起孩子反复高烧39℃以上。
此外，孩子在感染、接种疫苗后，或患有免疫缺陷病时，也可能出现反复高烧39℃以上的情况。如果孩子出现反复高烧，建议及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意给孩子多喝水，保持室内空气流通，饮食宜清淡易消化。