三个月宝宝咳嗽流鼻涕，可采取以下措施。
1.清理鼻腔：使用生理性海盐水滴鼻或喷鼻，软化或稀释鼻涕，然后使用吸鼻器吸出鼻涕，以缓解鼻塞和咳嗽。
2.补充水分：适当增加宝宝的液体摄入，有助于缓解咳嗽和稀化鼻涕。
3.保持适宜的环境温度和湿度：室内温度以22~24℃为宜，相对湿度保持在50%~60%。
4.调整体位：如果宝宝咳嗽严重，可以将其竖着抱起或侧卧，有助于缓解咳嗽。
5.注意观察：密切观察宝宝的精神状态、呼吸情况、体温等，如果出现发热、呼吸急促、喘息等异常，应及时就医。
6.就医治疗：如果宝宝咳嗽流鼻涕持续时间较长或症状加重，或者出现其他不适，如呼吸急促、喘息、发热等，应及时就医。医生可能会根据宝宝的具体情况，给予相应的治疗，如使用止咳药、祛痰药、抗生素等。
需要注意的是，三个月以下的宝宝咳嗽流鼻涕，应及时就医，因为他们的免疫系统尚未完全发育，咳嗽和流鼻涕可能是严重疾病的表现，如肺炎等。在就医过程中，应遵循医生的建议，按时给宝宝服药，并注意观察宝宝的病情变化。同时，家长应注意保持宝宝的个人卫生，勤洗手，避免带宝宝去人员密集的场所，以减少感染的机会。