吞咽时耳朵疼可能由多种原因引起。比如，当患有急性中耳炎时，就可能出现这种情况。急性中耳炎多发生在儿童身上，是因为上呼吸道感染等原因，细菌或病毒感染了中耳，炎症刺激会导致吞咽时耳朵疼，通常还会伴随听力下降、耳闷等症状。
一、耳部自身疾病导致
1. 外耳道炎： 外耳道皮肤及皮下组织的炎症。如果是急性外耳道炎，当吞咽时，下颌关节运动可能会牵扯到外耳道的神经，从而引起耳朵疼。外耳道炎患者往往还会有外耳道分泌物增多、耳朵瘙痒等表现。2. 中耳炎： 除了急性中耳炎，慢性中耳炎急性发作时也会出现吞咽时耳朵疼的情况。中耳炎是中耳部位的炎症，炎症刺激中耳的神经，在吞咽动作时，咽鼓管活动可能会影响中耳内的压力，进而导致疼痛放射到耳部。
二、咽部疾病引发
1. 扁桃体炎： 扁桃体发生炎症时，尤其是化脓性扁桃体炎。当吞咽时，咽部肌肉运动，炎症部位受到刺激，疼痛可能会放射到耳部。扁桃体炎患者通常会有扁桃体红肿、疼痛，甚至有脓性分泌物等症状。2. 咽炎： 急性咽炎发作时，咽部黏膜充血、肿胀，吞咽时刺激周围神经，疼痛可能会牵涉到耳部。咽炎患者常表现为咽部干燥、灼热、疼痛，吞咽时加重等症状。
三、神经牵涉因素
1. 舌咽神经痛： 舌咽神经分布区域的阵发性疼痛，疼痛可涉及耳部。吞咽、说话、咳嗽等动作都可能诱发疼痛。舌咽神经痛的疼痛比较剧烈，呈刺痛样。2. 三叉神经痛： 三叉神经的分支如果受到刺激，也可能导致耳部牵涉痛。当吞咽时，可能会触发三叉神经相关分支的疼痛，从而表现为耳朵疼。三叉神经痛通常疼痛突发突止，疼痛剧烈如电击样。