早上起来腹痛可能由多种原因引起。比如，大约有10%-20%的人可能是因为胃肠功能紊乱导致早上起来腹痛。
一、胃肠功能紊乱所致
饮食因素： 如果前一天晚上进食过多辛辣、油腻食物，就容易引起胃肠功能紊乱，导致早上起来腹痛。例如，前一晚吃了大量麻辣火锅，刺激胃肠，第二天早上可能出现腹痛。腹部着凉： 夜间睡眠时腹部保暖不当，腹部受凉后胃肠蠕动异常，也会引发早上腹痛。比如室温较低，又没盖好被子，腹部受寒，早上就可能觉得肚子痛。
二、消化系统疾病引发
胃炎： 患有胃炎的人，胃黏膜处于受损状态，早上起来胃酸分泌相对较多，刺激胃黏膜，就会出现腹痛。一般来说，有胃炎病史的人更容易在早上出现这种情况。十二指肠溃疡： 典型症状是空腹痛，也就是空腹时疼痛，早上起来处于空腹状态，胃酸进入十二指肠刺激溃疡面，会导致腹痛。通常十二指肠溃疡患者疼痛有一定规律性，早上起来腹痛较为常见。
三、肝胆疾病影响
胆囊炎： 胆囊有炎症时，夜间睡眠后，胆囊收缩等可能会刺激胆囊部位，导致早上起来右上腹腹痛。尤其是本身有胆囊炎，且胆囊内有结石等情况的人更易出现。肝炎： 某些类型的肝炎患者，肝脏炎症反应可能会牵扯周围组织，早上起来也可能有腹部不适、隐痛等情况。比如慢性肝炎患者，肝脏功能受影响，早上可能感觉肚子不舒服。