新生儿小便有血可能由以下原因引起：
1.生理性因素：
正常现象：在新生儿出生后的头几天，可能会出现小便带血的情况，这是由于胎儿在子宫内时，尿液中的红细胞会在出生后逐渐被吸收，导致小便中有血液。
假性月经：部分女婴在出生后5~7天，可能会出现阴道少量出血的现象，这是由于胎儿在母体内受到雌激素的影响，出生后雌激素水平下降，导致子宫内膜脱落引起的，一般持续1~3天会自然消退，无需特殊处理。
2.泌尿系统感染：
细菌感染：如膀胱炎、尿道炎等，可导致尿道黏膜充血、水肿，甚至出血。
病毒感染：如肾盂肾炎、肾小球肾炎等，也可引起血尿。
其他感染：如支原体、衣原体感染等，也可能导致泌尿系统炎症，出现血尿。
3.泌尿系统结构异常：
先天性畸形：如肾积水、输尿管畸形、膀胱输尿管反流等，可导致尿液排泄不畅，引起血尿。
后天性损伤：如肾脏外伤、尿道损伤等，可导致血尿。
4.其他疾病：
血液系统疾病：如血小板减少性紫癜、血友病等，可导致凝血功能障碍，引起血尿。
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮、过敏性紫癜等，可累及肾脏，导致血尿。
药物副作用：某些药物，如磺胺类药物、氨基糖苷类药物等，可能会引起肾脏损害，导致血尿。
如果发现新生儿小便有血，建议及时就医，进行详细的检查，如尿常规、血常规、泌尿系统超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意保持新生儿的尿道口清洁，避免感染。