坐动车时耳朵不舒服，可能与以下因素有关。
1.压力变化：动车在行驶过程中会产生气压变化，当压力变化较大时，可能会导致耳部不适，如耳闷、耳鸣等。
2.咽鼓管功能障碍：咽鼓管是连接中耳和咽部的通道，其主要功能是调节中耳压力。如果咽鼓管功能障碍，无法及时平衡中耳内外的压力，就可能导致耳部不适。
3.个人差异：每个人的耳部结构和生理功能都有所不同，有些人可能对气压变化更为敏感，容易出现耳部不适。
4.耳部疾病：如果本身存在耳部疾病，如中耳炎、鼓膜穿孔等，坐动车时可能会加重耳部不适。
针对以上情况，可以采取以下措施缓解耳部不适。
1.吞咽、咀嚼：在动车行驶过程中，可以通过频繁吞咽、咀嚼等动作，促进咽鼓管开放，平衡中耳内外压力。
2.按压耳屏：用手指按压耳屏，或轻轻按摩外耳道，也有助于缓解耳部不适。
3.闭嘴捏鼻鼓气：闭嘴后，用手指捏住鼻子，轻轻向耳朵吹气，使空气进入中耳，缓解耳部压力。
4.远离噪音：尽量避免在动车内使用耳机或调高音量，以减少噪音对耳部的刺激。
5.耳部不适严重时，应及时就医。
此外，如果本身存在耳部疾病，应在乘坐动车前咨询医生，了解相关注意事项。对于儿童、老人等特殊人群，耳部不适的发生率可能较高，应更加关注耳部健康。如果耳部不适持续时间较长或伴有其他症状，如听力下降、疼痛等，应及时就医，进行详细的耳部检查，以排除其他潜在的耳部疾病。