疱疹性咽峡炎和手足口病都是儿童常见的传染病，它们的区别主要体现在以下几个方面：
1.病原体不同：疱疹性咽峡炎是由柯萨奇A组病毒引起的，手足口病则是由肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇A组16型（CA16）等多种病毒引起的。
2.症状不同：疱疹性咽峡炎的主要症状是发热、咽痛、咽峡部疱疹，疱疹破溃后形成小溃疡，患儿常因咽痛而拒食、流涎。手足口病的皮疹主要出现在手、足、口腔、臀部等部位，少数患儿可出现心肌炎、肺水肿、无菌性脑膜脑炎等并发症。
3.传染性不同：疱疹性咽峡炎和手足口病都具有传染性，但手足口病的传染性更强。
4.治疗方法不同：疱疹性咽峡炎和手足口病的治疗方法相似，主要包括对症治疗和抗病毒治疗。患儿需要注意休息，多喝水，保持口腔清洁，避免食用辛辣、刺激性食物。如果患儿出现高热、精神萎靡等症状，需要及时就医。
综上所述，疱疹性咽峡炎和手足口病虽然都是儿童常见的传染病，但它们的病原体、症状、传染性和治疗方法等方面都有所不同。家长需要注意观察患儿的症状，及时就医，以便采取正确的治疗措施。