夜咳可能由多种原因引起，比如过敏因素，像过敏性鼻炎患者，夜间平躺时，鼻腔分泌物可能倒流刺激咽喉，约有30% - 40%的过敏性鼻炎患者会伴随夜间咳嗽症状；还有呼吸道感染，比如支气管炎患者，夜间迷走神经兴奋，气道反应性增高，炎症刺激会导致夜间咳嗽加重，一般上呼吸道感染后咳嗽可能会持续1 - 3周，下呼吸道感染如支气管炎、肺炎等引起的夜咳时间可能更长。
过敏因素导致的夜咳
室内过敏原：尘螨是常见的室内过敏原，它主要生活在床垫、枕头、沙发等处，夜间人体与这些物品接触较多，容易引发过敏反应导致夜咳。比如在有尘螨的环境中生活，约80%的过敏相关夜咳与尘螨有关。宠物毛发皮屑：家里养宠物的话，宠物的毛发和皮屑也是过敏原，夜间人在睡眠环境中接触到这些物质，就可能出现夜咳，尤其是对宠物毛发过敏的人群。
呼吸道感染引发的夜咳
上呼吸道感染后夜咳：当发生普通感冒等上呼吸道感染时，鼻腔、咽喉部会有炎症，夜间睡眠时，炎症刺激仍存在，就会引起夜咳。一般上呼吸道感染后的夜咳，多数在1 - 2周内会逐渐缓解，但也有少数人可能持续3周左右。下呼吸道感染后夜咳：像支气管炎、肺炎等下呼吸道感染，炎症会使气道产生更多分泌物，夜间平躺时，分泌物刺激气道会加重咳嗽。比如肺炎患者，夜咳可能会比较频繁，且咳嗽声音相对深沉，持续时间可能长达数周甚至数月。
其他因素导致的夜咳
胃食管反流：夜间平躺时，胃酸可能会反流至食管，刺激咽喉，从而引起夜咳。尤其是本身有胃食管反流基础疾病的人，这种情况更容易发生。一般有胃食管反流的患者，约50%会出现夜间咳嗽症状。环境因素：空气干燥、寒冷或者有刺激性气味等环境因素也可能导致夜咳。比如冬季室内空气干燥，湿度低于40%时，就容易刺激呼吸道引发夜咳；还有吸入烟雾、化学气体等刺激性物质，夜间接触后也会出现咳嗽。