EB病毒感染的治疗目前主要是对症支持治疗为主。因为EB病毒感染多为自限性疾病，多数情况下不需要特殊的抗病毒治疗就能自行恢复，但如果出现严重并发症等情况则需要针对性处理。
自限性疾病的一般处理
EB病毒感染多数呈自限性，患者需要多休息，保证充足的睡眠，一般休息时间建议每天7~8小时以上，让身体有足够的能量来对抗病毒。同时要注意加强营养，多摄入富含蛋白质、维生素的食物，比如每天可以吃200~300克的瘦肉、200克左右的新鲜蔬菜等，以增强机体免疫力。
出现并发症时的治疗
如果EB病毒感染引发了传染性单核细胞增多症等并发症，当有发热症状时，若体温超过38.5℃，可采用物理降温（如用温水擦拭额头、腋窝等部位）以及药物退热，不过药物选择需谨慎，一般不建议低龄儿童使用阿司匹林退热。如果出现肝损害等情况，可能需要使用一些保肝药物来保护肝脏功能，但具体药物使用要遵医嘱。
特殊人群的注意事项
对于儿童感染EB病毒，要密切观察病情变化，因为儿童免疫系统相对较弱，一旦出现精神差、持续高热不退等情况要及时就医。而对于免疫力低下的人群，比如艾滋病患者感染EB病毒后，治疗会更加复杂，需要在医生的严密监测下进行综合治疗，可能需要根据具体情况调整治疗方案来控制病情。