睡着不咳嗽醒了咳嗽可能由多种原因引起。比如，上呼吸道感染康复期可能出现这种情况，一般持续时间可能在1~2周左右。
气道敏感性因素
夜间睡眠时气道相对稳定： 人在睡眠状态下，身体处于放松状态，气道的敏感性相对较低。而清醒时，可能会接触到更多外界刺激，像冷空气、粉尘等，容易引发咳嗽。例如，有些过敏体质的人，夜间睡眠时接触过敏原较少，清醒后接触到过敏原就会出现咳嗽。鼻后滴漏综合征： 鼻腔分泌物在睡眠时可能向后流到咽喉部的量相对较少，对咽喉刺激轻；清醒时由于体位变化等因素，分泌物更容易流到咽喉，刺激咽喉引起咳嗽。比如患有鼻炎的人，夜间平躺时分泌物下流慢，清醒后活动多，分泌物下流刺激咽喉导致咳嗽。
疾病相关因素
胃食管反流病： 睡眠时平躺姿势可能使胃酸更容易反流至食管，刺激咽喉的情况相对较轻；清醒时站立或坐着，胃酸反流对咽喉刺激更明显。一般来说，有胃食管反流病的人，夜间睡觉时反流程度较轻，清醒后活动时反流加重，引发咳嗽。比如一些肥胖人群，患胃食管反流病的几率较高，容易出现睡着不咳嗽醒了咳嗽的情况。慢性支气管炎： 夜间睡眠时，呼吸道分泌物积聚相对缓慢，对气道刺激小；清醒后活动会使呼吸道分泌物移动，刺激气道引发咳嗽。慢性支气管炎患者，夜间睡眠时气道分泌物刺激轻，清醒后活动导致分泌物刺激气道引起咳嗽。例如长期吸烟的慢性支气管炎患者，更易出现这种情况。
环境因素
夜间环境相对稳定： 夜间环境温度、湿度等相对稳定，对呼吸道刺激小；清醒时可能处于不同环境，如从室内到室外，温度湿度变化大，容易刺激呼吸道引起咳嗽。比如从温暖室内到寒冷室外，清醒时就可能因温度变化刺激呼吸道导致咳嗽。夜间接触刺激物少： 夜间周围环境中可能接触的刺激性气体、粉尘等较少，清醒时可能会接触到更多，从而引发咳嗽。例如夜间在家中，接触刺激性气体少，白天外出可能接触到汽车尾气等刺激性气体引发咳嗽。