治疗慢性肠炎的药物可分为以下几类：
1.抗感染药物：根据细菌培养及药敏试验结果选择相应的抗感染药物。
2.对症治疗药物：
阿托品：具有解除胃肠道平滑肌痉挛、抑制腺体分泌的作用，可有效缓解腹痛、腹泻等症状。
地芬诺酯：可直接作用于肠道平滑肌，通过减弱肠蠕动而止泻。
蒙脱石散：一种新型胃肠黏膜保护剂，对消化道内的病毒、病菌及其产生的毒素有固定、抑制作用，还可修复、提高黏膜屏障对攻击因子的防御功能。
3.调节肠道菌群药物：如双歧杆菌三联活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等，可调整肠道菌群，缓解腹泻症状。
4.其他药物：
水杨酸偶氮磺胺吡啶：适用于轻型或重型经肾上腺糖皮质激素治疗已有缓解者。
肾上腺糖皮质激素：适用于暴发型或重型患者，可控制炎症，减轻中毒症状。
需要注意的是，慢性肠炎的治疗应根据具体病因和病情选择合适的药物。在使用药物治疗的同时，还应注意调整饮食、保持良好的生活习惯，以促进病情的恢复。此外，药物的使用应在医生的指导下进行，避免自行用药。
总之，治疗慢性肠炎的药物有很多种，应根据具体情况选择合适的药物。同时，还应注意调整饮食、保持良好的生活习惯，以促进病情的恢复。