肝内胆管结石的最佳治疗方法主要包括以下几种：
1.手术治疗：
肝切除术：对于病变局限于一叶或一段肝内胆管结石，且肝叶或肝段的功能正常，无肝硬化或仅有轻微肝硬化的患者，肝切除术是首选的治疗方法。手术可彻底去除结石，解除胆道梗阻，预防结石复发。
胆管切开取石术：对于肝内胆管结石局限于某一肝叶或肝段，且该肝叶或肝段的胆管扩张、结石易于取出的患者，可采用胆管切开取石术。手术通过胆总管切口将肝内胆管结石取出，同时进行胆道探查和引流。
胆肠吻合术：对于难以取净结石或存在胆管狭窄的患者，可行胆肠吻合术。手术将胆管与肠道吻合，使胆汁能够引流入肠道，以缓解胆道梗阻。
2.内镜治疗：
经内镜逆行胰胆管造影术（ERCP）：通过十二指肠镜逆行插入胆管，进行造影和取石。适用于胆总管结石的治疗，也可用于肝内胆管结石的治疗，但对于肝内胆管结石的取石效果可能不如手术。
经皮经肝胆道镜取石术（PTCS）：在超声或X线引导下，经皮经肝胆道穿刺，插入胆道镜进行取石。适用于肝内胆管结石局限于某一肝段或肝叶，且结石较小、无明显胆管狭窄的患者。
3.中西医结合治疗：
中药治疗：可采用一些具有利胆排石、清热解毒作用的中药，如金钱草、茵陈、柴胡等，以促进结石排出和缓解症状。
体外冲击波碎石：对于较小的肝内胆管结石，可采用体外冲击波碎石的方法将结石击碎，然后随胆汁排出体外。
4.其他治疗方法：
引流术：对于肝内胆管结石合并胆道感染、梗阻或胆汁淤积的患者，可行引流术，如T管引流、经皮肝穿刺胆道引流等，以减轻胆道炎症和缓解症状。
保肝治疗：对于合并肝功能损害的患者，需进行保肝治疗，以保护肝脏功能。
需要注意的是，肝内胆管结石的治疗方法应根据患者的具体情况进行选择，包括结石的大小、数量、位置、胆道狭窄情况、肝功能等因素。此外，治疗后还需要定期复查，以监测结石的复发情况。在治疗过程中，患者应积极配合医生的治疗，注意饮食调节，避免食用高胆固醇、高脂肪的食物，以预防结石的复发。如果对肝内胆管结石的治疗有疑问，建议咨询肝胆外科医生，以便获得更专业的建议和治疗方案。