扁桃体发炎咽喉肿痛时，可以使用以下药物进行治疗：
1.抗生素：如果是细菌感染引起的扁桃体发炎咽喉肿痛，医生可能会开抗生素，如阿莫西林、头孢呋辛酯等。
2.抗病毒药物：如果是病毒感染引起的扁桃体发炎咽喉肿痛，医生可能会开抗病毒药物，如利巴韦林、阿昔洛韦等。
3.解热镇痛药：如果疼痛严重，可以使用解热镇痛药，如对乙酰氨基酚、布洛芬等。
4.中药：一些中药也有清热解毒、利咽消肿的作用，如双黄连口服液、银翘解毒片等。
需要注意的是，使用药物治疗时，应遵循医生的建议，按照剂量和用药时间进行服用。同时，还应注意休息，多喝水，避免吃辛辣、刺激性食物。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医。此外，对于儿童、孕妇、老人等特殊人群，使用药物时应更加谨慎，最好在医生的指导下进行。