脚底长小水泡并伴有瘙痒，通常是由以下原因引起：
1.足癣：由真菌感染引起，具有传染性。除脚底外，足侧缘、足跟、趾间也可能出现水疱、红斑、鳞屑，伴瘙痒。水疱干涸后出现脱屑，可外用抗真菌药物治疗，如酮康唑乳膏、益康唑乳膏等，严重时需口服抗真菌药物，如伊曲康唑、特比萘芬等。治疗期间应注意个人卫生，保持足部清洁，勤换鞋袜，避免与他人共用拖鞋、洗脚盆等。
2.湿疹：与过敏、遗传、感染等因素有关。表现为红斑、丘疹、水疱、渗出、结痂、脱屑等，伴有瘙痒。可外用糖皮质激素乳膏，如糠酸莫米松乳膏、丁酸氢化可的松乳膏等，渗出多时可用硼酸溶液冷敷。严重者需口服抗组胺药，如氯雷他定、西替利嗪等。同时，应避免搔抓，避免接触过敏原。
3.汗疱疹：病因尚不明确，可能与精神因素、过敏、感染等有关。好发于夏季，表现为深在性小水疱，粟粒至米粒大小，略高出皮肤表面，常伴有不同程度的灼热感和瘙痒。水疱干涸后出现脱屑，可外用糖皮质激素乳膏，如曲安奈德尿素乳膏、糠酸莫米松乳膏等。瘙痒明显时可口服抗组胺药，如氯雷他定、西替利嗪等。
4.其他：接触性皮炎、手足口病、扁平苔藓等也可能出现脚底小水泡伴瘙痒的症状。
如果脚底小水泡瘙痒持续不缓解或加重，建议及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。同时，要注意保持足部清洁，避免搔抓，避免穿不透气的鞋子。