脚底长小水疱的原因和处理方法如下：
1.足癣：由真菌感染引起，水疱可分散或融合，伴有瘙痒。可外用抗真菌药物，如酮康唑乳膏、特比萘芬乳膏等，严重者可口服抗真菌药物，如伊曲康唑、特比萘芬等。同时，要保持足部清洁干燥，勤换鞋袜，避免与他人共用拖鞋、浴巾等物品。
2.汗疱疹：与过敏、感染、精神紧张等因素有关，好发于手掌、足底，水疱壁厚，伴有瘙痒或烧灼感。可外用糖皮质激素软膏，如糠酸莫米松乳膏、丁酸氢化可的松乳膏等，严重者可口服抗组胺药物，如氯雷他定、西替利嗪等。此外，要避免接触过敏原，保持心情舒畅。
3.湿疹：由多种内外因素引起的皮肤炎症反应，可表现为红斑、丘疹、水疱等，伴有瘙痒。可外用糖皮质激素软膏，如卤米松乳膏、糠酸莫米松乳膏等，渗出明显者可用硼酸溶液湿敷，严重者可口服抗组胺药物，如氯雷他定、依巴斯汀等。同时，要避免搔抓患处，避免热水烫洗，饮食宜清淡，避免食用辛辣刺激性食物。
4.其他：手足口病、水痘等也可出现脚底长小水疱的症状，建议及时就医，明确诊断后进行治疗。
总之，脚底长小水疱的原因较多，处理方法也不同。建议及时就医，明确诊断后进行治疗。同时，要注意保持足部清洁干燥，避免搔抓患处，避免与他人共用鞋袜、浴巾等物品。