跖疣初期小泡泡的治疗方法如下：
1.冷冻治疗：通过低温液氮将跖疣初期的小泡泡冻死，从而达到治疗的效果。一般需要进行1-3次，每次间隔1-2周。
2.激光治疗：利用激光的高温将跖疣初期的小泡泡碳化，从而达到治疗的目的。该方法也需要进行1-3次，每次间隔1-2周。
3.外用药物治疗：可以使用5%咪喹莫特乳膏、0.5%鬼臼毒素酊等药物涂抹在跖疣初期的小泡泡上，每天1-2次，坚持使用2-4周。需要注意的是，这些药物可能会引起局部刺激和过敏反应，使用时应注意保护周围皮肤。
4.口服药物治疗：如果跖疣初期的小泡泡较多或症状较严重，可以口服抗病毒药物，如利巴韦林、阿昔洛韦等，以抑制病毒复制，促进疣体消退。
以上内容仅供参考，如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。同时，在治疗期间应注意保持足部清洁干燥，避免搔抓和挤压疣体，以免引起感染和扩散。