胎儿DNA亲子鉴定的方法主要有以下几种：
1.无创产前亲子鉴定：又称无创胎儿亲子鉴定、无创孕期亲子鉴定，是利用新一代DNA测序技术对母体外周血中的游离DNA片段（包含胎儿游离DNA）进行测序、生物信息分析，从中得到胎儿的遗传信息来确认亲子关系。
优点：无创取样，只需要采集孕妇外周血，无痛苦；无感染风险，更无流产事件，保障宝宝的安全；鉴定孕期长，怀孕5周至宝宝诞生前均可检测；样本可邮寄，保障客户隐私。
适用人群：胎盘前置、孕囊低置、羊水过少、RH血型阴性、流产史、先兆流产或珍贵儿等。
2.羊水亲子鉴定：在怀孕16周-24周左右可以通过三甲医院手术采集胎儿的羊水样本，然后和可疑父亲的样本、母亲的样本一起做分析，得出胎儿与可疑父亲之间是否具有亲子关系。
优点：羊水亲子鉴定是一种三联体鉴定，鉴定时需要提供母亲DNA样本、假定父亲DNA样本以及胎儿样本（羊水），三者缺一不可。
适用人群：适用于怀孕16周-24周的孕妇。
3.绒毛亲子鉴定：在怀孕11周-13周左右可以通过三甲医院手术采集胎儿的绒毛样本，然后和可疑父亲的样本、母亲的样本一起做分析，得出胎儿与可疑父亲之间是否具有亲子关系。
优点：绒毛亲子鉴定和羊水亲子鉴定一样，都是通过三甲医院手术采集胎儿的样本，所以也存在一定的风险，有可能会导致胎儿畸形或者流产。
适用人群：适用于怀孕11周-13周的孕妇。
需要注意的是，胎儿亲子鉴定的结果可能会受到多种因素的影响，如样本质量、检测方法、实验室条件等。因此，在进行胎儿亲子鉴定时，需要选择正规的亲子鉴定机构，并严格按照操作规程进行操作，以确保检测结果的准确性和可靠性。同时，胎儿亲子鉴定也需要遵循相关的法律法规和伦理道德规范，保护孕妇和胎儿的权益。