39周胎监不合格的原因可能有以下几点：
1.胎儿自身因素：
胎儿睡眠状态：如果胎儿在进行胎监时处于睡眠状态，可能会导致胎动减少，从而影响胎监结果。
胎儿发育异常：一些胎儿可能存在先天性心脏疾病、神经系统发育异常等问题，这些问题可能会影响胎儿的胎动和胎心监护结果。
胎儿宫内窘迫：如果胎儿在子宫内出现缺氧等情况，也会导致胎监不合格。
2.孕妇自身因素：
孕妇情绪紧张：孕妇在进行胎监时如果过于紧张或焦虑，可能会影响胎儿的胎动和胎心监护结果。
孕妇使用药物：一些药物，如镇静剂、降压药等，可能会影响胎儿的胎心和胎动，导致胎监不合格。
孕妇身体不适：孕妇如果患有疾病，如发热、低血糖、贫血等，可能会影响胎儿的健康状况，导致胎监不合格。
3.其他因素：
胎监时间：胎监的时间选择也很重要，如果在胎儿活动较少的时间段进行胎监，可能会导致结果不理想。
胎监设备：胎监设备的性能和准确性也会影响胎监结果，如果设备出现故障或校准不准确，可能会导致误判。
如果39周胎监不合格，医生可能会建议进行以下处理：
1.复查胎监：医生会让孕妇再次进行胎监，以确定结果的准确性。
2.进行B超检查：B超检查可以更直观地了解胎儿的情况，包括胎儿的心率、胎动、羊水量等。
3.进行胎心监护：如果B超检查结果正常，但胎监仍不合格，医生可能会建议进行胎心监护，以了解胎儿在宫内的情况。
4.采取措施：根据胎儿的具体情况，医生可能会采取以下措施，如吸氧、静脉点滴等，以改善胎儿的宫内环境。
5.适时终止妊娠：如果胎儿出现宫内窘迫等紧急情况，医生可能会建议适时终止妊娠，以确保胎儿的安全。
需要注意的是，每个孕妇和胎儿的情况都不同，医生会根据具体情况制定个性化的治疗方案。孕妇在进行胎监时应放松心情，积极配合医生的检查。如果对胎监结果有任何疑问，应及时与医生沟通。