肛门上有个疙瘩并伴有疼痛，可能是以下原因引起：
1.痔疮：内痔或混合痔可脱出肛门外，伴有肛门部肿物，有时伴疼痛。
2.肛裂：肛管皮肤全层裂开后形成的小溃疡，可引起肛门疼痛、便血和肛门部肿物。
3.肛周脓肿：肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿，可伴有疼痛、发热等症状。
4.直肠脱垂：肛管、直肠黏膜或直肠全层脱出肛门外，可伴有肛门坠胀感、排便不尽感等。
5.其他：肛门部皮脂腺囊肿感染、血栓性外痔、肛管直肠癌等也可出现肛门部肿物伴疼痛。
如果出现肛门上有个疙瘩并伴有疼痛，建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。治疗方法包括药物治疗、坐浴、手术治疗等，具体治疗方法应根据病因和病情而定。同时，应注意保持肛门部清洁，避免久坐、久站，饮食清淡，避免辛辣刺激性食物。