肛门上方有个小疙瘩并伴有疼痛，可能是以下原因引起：
1.外痔：肛门口有肿物隆起，伴有肛门坠胀、疼痛，可能是外痔。外痔位于齿状线以下，由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成。
2.肛周脓肿：肛门周围出现小疙瘩，并逐渐肿大、疼痛，可能是肛周脓肿。它是由于肛窦炎、肛门周围皮肤毛囊汗腺炎等感染，炎症扩展至肛管直肠周围间隙而形成。
3.肛裂：肛门有裂口，排便时疼痛，伴有肛门肿物脱出，可能是肛裂。肛裂是肛管皮肤全层裂伤后形成的感染性溃疡，典型症状是疼痛、便秘和出血。
4.肛管或直肠肿瘤：肛门附近出现疙瘩，伴有疼痛、出血、大便习惯改变等，可能是肛管或直肠肿瘤。
针对以上情况，可采取以下措施：
1.注意个人卫生，保持肛门清洁。
2.饮食清淡，多吃蔬菜水果，避免辛辣刺激性食物。
3.养成良好的排便习惯，避免便秘。
4.避免久坐久站，适当运动。
5.如症状持续不缓解或加重，应及时就医，明确诊断后进行治疗。
以上内容仅供参考，具体治疗方法请在医生的指导下进行。