肛门有个小疙瘩并伴有疼痛，可能是以下原因引起：
1.痔疮：痔疮是肛门常见的疾病，通常是由于肛门静脉曲张引起。内痔或混合痔可脱出肛门外，有时可伴有疼痛。
2.肛裂：肛裂是肛管皮肤裂伤后形成的小溃疡，典型表现为肛门疼痛、出血和便秘。
3.肛周脓肿：是肛门周围组织的急性化脓性感染，可形成脓肿，伴有疼痛、红肿和发热等症状。
4.肛管炎：肛管炎是肛管的炎症性疾病，可导致肛门疼痛、瘙痒和分泌物增多。
5.直肠肿瘤：肛门部的恶性肿瘤，如直肠癌，也可出现肛门肿物和疼痛。
针对这种情况，以下是一些建议：
1.保持肛门清洁：每天用温水清洗肛门，保持局部清洁干燥。
2.调整饮食：多吃蔬菜、水果和粗粮，避免辛辣刺激性食物，保持大便通畅。
3.避免久坐：长时间久坐会增加肛门部位的压力，应适当活动。
4.就医诊治：如果症状持续不缓解或加重，应及时就医，进行详细的检查，如肛门指诊、肛门镜等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。
需要注意的是，以上建议仅供参考，具体治疗方法应根据个人情况和医生的建议进行选择。如果对肛门小疙瘩和疼痛的原因存在疑虑，建议咨询医生或肛肠科专家，以获得更专业的建议和治疗方案。