怀孕三个月肚脐眼周围疼，可能是以下原因引起：
1.子宫增大：怀孕后，子宫逐渐增大，可能会牵拉周围的韧带，引起肚脐眼周围疼痛。这是正常的生理现象，通常不需要特殊处理，注意休息即可。
2.胃肠道不适：怀孕后，体内激素水平的变化可能会影响胃肠道的功能，导致消化不良、胃痛、胃胀等不适，也可能引起肚脐眼周围疼痛。此时应注意饮食清淡，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，同时可以采取少量多餐的方式，缓解胃肠道的不适。
3.腹部受凉：如果肚脐眼周围受凉，可能会引起肠痉挛，导致疼痛。孕妇应注意腹部保暖，避免着凉。
4.其他：如果肚脐眼周围疼痛伴有阴道流血、发热、呕吐等症状，可能是其他疾病引起，如先兆流产、胃肠炎、阑尾炎等，需要及时就医，明确诊断，并进行相应的治疗。
需要注意的是，每个孕妇的情况都可能不同，如果肚脐眼周围疼痛持续不缓解或伴有其他异常症状，应及时就医，以便医生进行详细的检查和诊断，并给予相应的治疗。同时，孕妇在孕期应注意休息，避免过度劳累，保持良好的心情，定期进行产前检查，以确保自身和胎儿的健康。