药流后40多天仍有阴道出血，可能是以下原因引起：
1.药流不全：药流后如果宫腔内有残留组织，会导致阴道出血淋漓不尽。需要进行B超检查，确认宫腔内是否有残留。如果有残留，需要进行清宫手术。
2.子宫复旧不良：药流后子宫需要一段时间恢复，如果子宫复旧不良，也会导致阴道出血时间延长。可以使用促进子宫收缩的药物，如益母草、新生化颗粒等，帮助子宫收缩，促进恢复。
3.感染：药流后如果不注意个人卫生，容易引起感染，导致子宫内膜炎等疾病，也会出现阴道出血。需要进行抗感染治疗，使用抗生素等药物。
4.内分泌失调：药流可能会影响女性的内分泌系统，导致内分泌失调，从而引起阴道出血。可以进行激素六项检查，根据检查结果进行调理。
5.其他：药流后过度劳累、情绪波动、性生活等也可能会导致阴道出血时间延长。
如果药流后40多天仍有阴道出血，建议及时就医，进行相关检查，明确原因后采取相应的治疗措施。同时，药流后要注意休息，保持个人卫生，避免过度劳累和性生活。如果出血量较大、腹痛等症状加重，应立即就医。