药流后40多天仍有阴道出血，可能是以下原因导致，建议及时就医，采取相应的治疗措施：
1.药流不全：药流后如果宫腔内有残留组织，会导致阴道出血淋漓不尽。B超检查可以明确诊断，如果残留物较小，可以口服益母草颗粒、新生化颗粒等药物促进残留物排出；如果残留物较大，需要进行清宫手术。
2.子宫复旧不良：药流后子宫需要一段时间恢复，如果子宫复旧不良，也会导致阴道出血时间延长。可以口服益母草胶囊、缩宫素等药物促进子宫收缩，帮助子宫恢复。
3.感染：药流后如果不注意个人卫生，容易引起感染，导致子宫内膜炎、盆腔炎等，也会出现阴道出血的症状。需要进行抗感染治疗，口服头孢呋辛酯片、甲硝唑片等药物。
4.其他：药流后内分泌失调、子宫内膜息肉、子宫肌瘤等也会导致阴道出血。需要进行性激素六项检查、B超检查等，明确病因后进行针对性治疗。
此外，药流后要注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持会阴部清洁卫生，一个月内禁止性生活和盆浴。饮食上要多吃一些富含蛋白质和维生素的食物，促进身体恢复。如果药流后40多天仍有阴道出血，建议及时就医，以免延误病情。