早上起来尿尿疼，可能是以下原因引起：
1.尿道炎：尿道炎是一种常见的泌尿系统感染，可导致尿道口红肿、疼痛、尿频、尿急、尿痛等症状。尿道炎可由细菌、病毒、支原体等感染引起。常见的尿道炎有淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎。治疗尿道炎通常采用抗生素治疗，如头孢呋辛酯、左氧氟沙星等。同时，应注意多饮水，促进排尿，有助于缓解症状。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱的炎症，也可导致尿尿疼痛。除尿痛外，还可能伴有尿频、尿急、尿不尽等症状。膀胱炎的治疗方法与尿道炎类似，主要是使用抗生素进行抗感染治疗。此外，还应注意休息，多饮水，保持尿道口清洁。
3.前列腺炎：前列腺炎是男性常见的疾病，可引起尿频、尿急、尿痛、尿不尽、会阴或耻骨上区疼痛等症状。前列腺炎的治疗方法包括药物治疗、物理治疗等。药物治疗常使用抗生素、α受体阻滞剂等。物理治疗包括前列腺按摩、热敷、微波等。
4.泌尿系统结石：泌尿系统结石如肾结石、输尿管结石等，也可导致尿尿疼痛。结石可刺激尿路黏膜，引起疼痛和血尿。治疗方法根据结石的大小、位置等因素而定，较小的结石可通过多饮水、运动等方法促进排出，较大的结石可能需要进行体外冲击波碎石或手术治疗。
5.其他原因：其他原因如尿道口息肉、尿道口狭窄、膀胱肿瘤等也可能导致尿尿疼痛。
如果出现早上起来尿尿疼的情况，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、尿培养、泌尿系统超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，应注意个人卫生，保持尿道口清洁，避免憋尿，多饮水，多排尿，有助于预防泌尿系统感染的发生。