五个月大的宝宝睡觉时摇头，可能与以下原因有关：
1.正常的生理现象：宝宝的前庭功能尚未发育完善，会出现摇头的现象，这是正常的生理现象，随着宝宝的生长发育，这种情况会逐渐消失。
2.湿疹：如果宝宝头部有湿疹，会因为瘙痒而出现摇头的现象，同时还可能伴有皮肤发红、脱屑等症状。
3.缺钙：宝宝缺钙时，会导致神经兴奋性增加，出现多汗、摇头、夜惊等症状，严重时还可能出现骨骼畸形。
4.中耳炎：如果宝宝患有中耳炎，会因为耳部疼痛而出现摇头的现象，同时还可能伴有哭闹、发热等症状。
5.头皮瘙痒：如果宝宝的头部出汗较多，没有及时清洗，会导致头皮瘙痒，从而出现摇头的现象。
如果宝宝只是偶尔摇头，没有其他异常表现，可以先观察一段时间。如果宝宝经常摇头，或者伴有其他异常表现，建议及时就医，明确原因，以便采取相应的治疗措施。