脖子两侧长痘痘的原因可能有以下几种：
1.痤疮：痤疮是一种毛囊皮脂腺的慢性炎症性疾病，好发于青少年，与雄激素水平增加、皮脂分泌增加、痤疮丙酸杆菌繁殖、毛囊皮脂腺导管角化异常等有关。痤疮可发生于身体任何部位，包括脖子两侧。
2.马拉色菌毛囊炎：马拉色菌毛囊炎是由马拉色菌感染引起的一种毛囊炎症性皮肤病，与高温、多汗、多脂、营养不良、免疫力下降等有关。马拉色菌毛囊炎可发生于颈部、前胸、后背等部位。
3.其他原因：脖子两侧长痘痘还可能与过敏、感染、内分泌失调、遗传等因素有关。
需要注意的是，痘痘的形成原因可能因人而异，如果痘痘持续不愈或伴有其他症状，建议及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。同时，保持良好的生活习惯，如保持皮肤清洁、避免搔抓、饮食清淡等，有助于缓解痘痘问题。