新生儿大便水便分离，可能与以下因素有关：
1.正常情况：
新生儿的肠道功能尚未完全发育成熟，大便可能比较稀，有时会出现水便分离的情况。
母乳喂养的宝宝，大便可能比较稀，其中可能有较多的奶瓣，这是正常的。
2.消化不良：
宝宝吃得过多或过快，可能导致消化不良，引起大便水便分离。
宝宝对某些食物过敏或不耐受，也可能导致消化不良。
3.感染：
病毒或细菌感染，如秋季腹泻，可能导致宝宝大便水样，次数增多。
肠道感染还可能伴有发热、呕吐等症状。
4.乳糖不耐受：
宝宝体内缺乏乳糖酶，无法消化乳糖，可能导致大便水便分离。
这种情况在母乳喂养的宝宝中比较常见。
5.其他：
腹部受凉、药物副作用等也可能导致宝宝大便异常。
如果宝宝精神状态良好，体重增长正常，可能是正常的。但如果宝宝出现以下情况，需要及时就医：
1.大便次数明显增多。
2.大便中含有脓血、黏液。
3.宝宝出现发热、呕吐、腹痛等症状。
4.宝宝精神萎靡、食欲不振。
医生可能会根据宝宝的具体情况进行检查，如大便常规、血常规等，以明确原因。治疗方法可能包括：
1.调整饮食：如果是消化不良或乳糖不耐受引起的，可以调整饮食，如减少奶量、添加乳糖酶等。
2.药物治疗：根据病因，医生可能会开一些药物，如益生菌、蒙脱石散等。
3.治疗原发病：如果是感染引起的，需要进行抗感染治疗。
需要注意的是，每个宝宝的情况都不同，治疗方法也可能因人而异。在处理宝宝的大便问题时，最好咨询医生的意见。同时，要注意保持宝宝的臀部清洁干燥，预防尿布疹的发生。