6岁孩子肚子疼但淋巴结不肿大，可能由以下原因引起。
1.肠痉挛：这是一种常见的儿科疾病，主要与饮食、环境变化、肠道气体积聚等因素有关。肠痉挛可导致孩子阵发性腹痛，多在脐周，可自行缓解。
2.急性胃炎：孩子吃了不干净的食物或受冷后，可能会引发急性胃炎，出现上腹痛、腹胀、恶心、呕吐等症状。
3.肠系膜淋巴结炎：孩子上呼吸道感染后，可引起肠系膜淋巴结炎，导致腹痛，但淋巴结不一定肿大。
4.肠梗阻：肠道内容物不能正常运行或通过，可引起肠梗阻，导致腹痛、呕吐、停止排气排便等症状。
5.其他：如腹型癫痫、铅中毒、肠痉挛等，也可能导致孩子肚子疼。
如果孩子肚子疼持续不缓解，或伴有其他症状，如发热、呕吐、腹泻、脓血便等，应及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。