包茎上长小疙瘩的原因有很多，主要包括以下几个方面：
1.感染：包茎过长容易藏污纳垢，导致细菌、病毒等感染，从而引起龟头炎、包皮炎等疾病，出现小疙瘩。此外，性传播疾病如尖锐湿疣、生殖器疱疹等也可能导致包茎上长小疙瘩。
2.过敏：使用某些药物、避孕套、润滑剂等过敏，或者对内裤材质过敏，也可能引起包茎上长小疙瘩。
3.损伤：包茎上的小疙瘩也可能是由于损伤引起的，如摩擦、咬伤、烫伤等。
4.肿瘤：包茎上的小疙瘩还可能是肿瘤的表现，如尖锐湿疣、阴茎癌等。
5.其他：包茎上长小疙瘩还可能与内分泌失调、自身免疫性疾病等有关。
需要注意的是，包茎上长小疙瘩可能是一种疾病的表现，也可能是其他问题的并发症。如果发现包茎上有小疙瘩，应及时就医，进行相关检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，应注意个人卫生，保持包茎清洁干燥，避免不洁性行为。