怀孕40天孕囊的大小因人而异，一般在5mm-10mm之间。但需要注意的是，孕囊的大小并不能完全代表胎儿的发育情况，还需要结合其他指标进行综合判断。
以下是一些可能影响孕囊大小的因素：
1.受孕时间：如果受孕时间较晚，孕囊可能会相对较小。
2.月经周期：月经周期不规律的女性，孕囊大小可能会与停经时间不符。
3.胚胎发育：如果胚胎发育缓慢，孕囊也可能会较小。
此外，在怀孕早期，还需要关注孕囊的位置、形态、有无胎心搏动等指标，以确保胎儿的健康。如果对孕囊大小有任何疑虑，建议及时咨询医生，医生会根据具体情况进行评估和指导。
需要注意的是，每个人的身体状况和怀孕情况都不同，因此上述内容仅供参考。如果您有其他相关问题或需要进一步的医疗建议，请咨询专业的医生。