HPV阴性但有疣体可能是假阳性结果、其他病毒感染、免疫抑制、疣体类型或检测局限性等原因引起，医生通常会建议复查HPV、观察和监测疣体、进一步检查、治疗疣体、增强免疫力，并告知注意事项。
HPV阴性但是有疣体，可能是以下原因引起：
1.假阳性结果：HPV检测可能出现假阳性，尤其是当采集的样本质量不佳、检测方法不敏感或患者正在接受某些药物治疗时。
2.其他病毒感染：除了HPV外，还有其他病毒可以引起疣体，如人类乳头瘤病毒6和11型以外的其他类型乳头瘤病毒。
3.免疫抑制状态：免疫系统功能低下的个体，如接受免疫抑制剂治疗、患有艾滋病等，可能更容易感染病毒并出现疣体，即使HPV检测为阴性。
4.疣体类型：某些类型的疣体，如扁平疣、寻常疣等，可能与HPV感染无关，而是由其他因素引起。
5.检测局限性：HPV检测主要针对常见的高危型HPV，但并不能检测到所有类型的HPV感染，也不能排除其他潜在的感染或病变。
对于HPV阴性但有疣体的情况，医生可能会采取以下措施：
1.重复检测：建议进行HPV检测的复查，以确保结果的准确性。
2.观察和监测：医生会密切观察疣体的变化情况，包括大小、形状、数量等，以及是否有新的疣体出现。
3.进一步检查：根据具体情况，医生可能会建议进行其他检查，如组织病理学检查，以确定疣体的性质和病因。
4.治疗疣体：无论HPV检测结果如何，疣体通常都需要治疗。治疗方法包括物理治疗（如冷冻、激光、电灼等）、外用药物（如抗病毒药物、角质促成剂等）或手术切除等。
5.增强免疫力：对于免疫功能低下的患者，医生可能会建议采取措施增强免疫力，如保持良好的生活习惯、均衡饮食、适当运动等。
6.告知注意事项：医生会告知患者注意个人卫生，避免搔抓疣体，以免扩散感染；同时，建议避免与他人共用毛巾、浴巾等物品，以减少传播的风险。
需要注意的是，HPV阴性但有疣体的情况并不罕见，具体原因需要根据个体情况进行综合判断。患者应及时就医，遵循医生的建议进行进一步的检查和治疗。此外，定期进行妇科检查和HPV检测对于预防宫颈癌等疾病仍然非常重要。