甲硝唑和奥硝唑都是硝基咪唑类抗生素，在化学结构、抗菌谱、药代动力学、适应症、不良反应和药物相互作用等方面存在一定的区别。使用时需注意对药物过敏者禁用，孕妇及哺乳期妇女、有活动性中枢神经系统疾病和血液病者、肝功能减退者、肾功能减退者、儿童等特殊人群需谨慎使用，用药期间应避免饮酒，且均需在医生的指导下使用。
一、甲硝唑和奥硝唑的区别：
1.化学结构不同：甲硝唑的化学名为2甲基5硝基咪唑1ethanol；奥硝唑的化学名为1[（乙氧基羰基）氧基]2羟甲基2甲基丙烷。
2.抗菌谱不同：甲硝唑对大多数厌氧菌具有强大的抗菌作用，包括脆弱拟杆菌、产气荚膜梭菌等；奥硝唑对厌氧菌的抗菌作用更强，对脆弱拟杆菌、梭杆菌属、消化球菌、消化链球菌、丙酸杆菌等厌氧菌的抗菌活性优于甲硝唑。
3.药代动力学不同：甲硝唑口服吸收良好，生物利用度达80%以上；奥硝唑的口服生物利用度接近100%，且不受食物影响。甲硝唑的蛋白结合率约为45%，主要经肝脏代谢，代谢产物为具有活性的2羟甲基甲硝唑；奥硝唑的蛋白结合率较低，约为15%，主要经肾脏排泄。
4.适应症不同：甲硝唑主要用于治疗厌氧菌感染，如口腔炎、牙龈炎、盆腔炎、腹膜炎、阿米巴痢疾等；奥硝唑除了用于厌氧菌感染外，还可用于治疗滴虫病、贾第鞭毛虫病等。
5.不良反应不同：甲硝唑的不良反应主要有胃肠道反应、头痛、眩晕等；奥硝唑的不良反应较甲硝唑少，主要有恶心、呕吐、头痛、眩晕等。
6.药物相互作用不同：甲硝唑可抑制华法林和其他口服抗凝药的代谢，增强其抗凝作用；奥硝唑与华法林等抗凝药合用时，可能会增强抗凝作用，需调整抗凝药的剂量。甲硝唑可干扰乙醇的代谢，导致乙醛蓄积，出现醉酒样反应；奥硝唑与乙醇无相互作用。
二、注意事项：
1.对甲硝唑或奥硝唑过敏者禁用。
2.有活动性中枢神经系统疾病和血液病者禁用甲硝唑。
3.孕妇及哺乳期妇女禁用甲硝唑。
4.用药期间应避免饮酒，以免发生戒酒硫样反应。
5.肝功能减退者慎用甲硝唑，肾功能减退者慎用奥硝唑。
6.甲硝唑可透过胎盘，迅速进入胎儿循环，且可随乳汁分泌，孕妇及哺乳期妇女使用甲硝唑时需权衡利弊。
7.奥硝唑可影响儿童的神经发育，因此儿童使用奥硝唑时需谨慎。
8.甲硝唑和奥硝唑均为处方药，需在医生的指导下使用。