补牙后一直隐隐自发疼可能有以下原因：
1.补牙时未垫底或垫底材料选择不当：如果深龋患牙在补牙时未垫底，或垫底材料选择不当，在外界刺激下可能出现冷热刺激痛或自发痛。
2.深龋未处理干净：如果深龋患牙洞内腐质未去净，或腐质下仍有细菌感染，在补牙后可能会出现冷热刺激痛或自发痛。
3.牙髓受激惹：补牙过程中，如制备洞形时的机械刺激、垫底材料中的某些化学刺激，以及制备洞形后消毒药物刺激等，都可能引起牙髓充血，导致补牙后出现短暂的疼痛，但一般可在短期内自行恢复。
4.已有牙髓炎或根尖周炎：如果患牙本身已有牙髓炎或根尖周炎，补牙后可能会出现疼痛加重的情况。
5.其他：如补牙后咬合过高、补牙后患牙受到外力撞击等，也可能导致补牙后出现自发痛。
针对补牙后一直隐隐自发疼的情况，可以采取以下措施：
1.观察：如果疼痛较轻，可以先观察一段时间，看是否会自行缓解。在此期间，应避免用患侧咀嚼食物，避免食用辛辣、刺激性食物，以及过冷、过热的食物。
2.药物治疗：如果疼痛较明显，可以在医生的指导下服用一些止痛药，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。同时，还可以使用一些具有止痛作用的漱口水，如复方硼砂溶液、呋喃西林溶液等。
3.就医复诊：如果疼痛持续不缓解，或出现加重的情况，应及时就医复诊。医生会根据具体情况进行检查，如X线检查等，以确定疼痛的原因，并采取相应的治疗措施。治疗方法可能包括重新补牙、根管治疗、拔牙等。
需要注意的是，每个人的情况都可能不同，如果对补牙后出现的疼痛有疑问或担忧，应及时与医生沟通，以便获得更专业的建议和治疗。同时，在补牙后，应注意口腔卫生，正确刷牙，定期洗牙，以维护口腔健康。