我国除特殊行业外，一般入职体检不得强制检查乙肝五项，然而部分企业包括医药公司可能未严格按要求执行，劳动者若发现企业违规检查乙肝五项并受不公平对待应维权，同时企业也应加强相关法律法规学习，规范入职体检流程，营造公平就业环境。
医药公司入职体检是否检查乙肝五项，不能一概而论。在我国，相关法律法规明确规定，除某些特殊行业外，一般的入职体检不得强制检查乙肝五项。对于事业编制单位，如公务员查体，按照国家要求是不查乙肝五项的。然而，对于企业，包括医药公司，情况则较为复杂。虽然国家有规定，但部分企业可能并未严格按照要求执行，仍然存在检查乙肝五项的情况。
具体来说，以下几点需要注意：
1.法律法规：我国法律旨在消除对乙肝病毒携带者的就业歧视，保障他们的平等就业权利。除了国家规定的特殊行业，如食品加工、保育行业等，一般行业的入职体检不应将乙肝五项作为常规检查项目。
2.企业行为：部分企业可能由于对相关法律法规的认识不足或其他原因，仍然进行乙肝五项的检查。这种行为不仅违反了国家规定，也可能对乙肝病毒携带者的就业权益造成损害。
3.权益保障：如果劳动者在入职体检中发现企业违规检查乙肝五项，并因此受到不公平的对待，应及时向劳动监察部门反映，维护自己的合法权益。
总之，医药公司入职体检是否检查乙肝五项，取决于企业是否严格遵守国家法律法规。劳动者应增强自身的法律意识，维护自己的合法权益。同时，企业也应加强对相关法律法规的学习，规范入职体检流程，营造公平、公正的就业环境。